霍姆斯和一小群同事立即开始分析基因组，寻找有关病毒进化史的线索。他们利用了已知冠状病毒的背景，以及他们自己对这种病毒在野外如何形成的理解（参见霍姆斯2009年出版的《rna病毒的进化和出现》一书）。